Ещё до начала этой истории огромное землетрясение опустошило большую часть японских земель и практически уничтожило Токио, погрузив три четверти города под воду.

История переносит нас на 10 лет вперёд к Игараши Ганте, казалось бы обычному скромному мальчику, учащемуся в средней школе префектуры Нагано. Выживший в том ужасном землетрясении, он ничего не помнит о трагедии и живёт нормальной спокойной жизнью.

Но всё меняется в тот день, когда какой-то человек, весь в крови, влетает в класс Ганты через окно. С безумной ухмылкой Красный Человек вырезает весь класс, но вместо того, чтобы убить и Ганту, тот внедряет ему в грудь красный осколок кристалла.

Спустя несколько дней после резни, Ганта оказывается единственным подозреваемым. И после подозрительно быстрого суда его приговаривают к пожизненному заключению в "Стране чудес смертников" ("Deadman Wonderland"), частной тюрьме, похожей на парк развлечений.